Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PTPRDP23468 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRDP23468 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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