Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSHP23434 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GCSHP23434 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms