Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TCEA1P23193 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TCEA1P23193 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms