Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BCL3P20749 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCL3P20749 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCL3P20749 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms