Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA6P17066 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA6P17066 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA6P17066 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPA6P17066 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms