Protein–RNA interactions for Protein: P14138

EDN3, Endothelin-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN3P14138 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDN3P14138 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDN3P14138 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDN3P14138 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EDN3P14138 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDN3P14138 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EDN3P14138 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EDN3P14138 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EDN3P14138 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EDN3P14138 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EDN3P14138 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EDN3P14138 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms