Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN1P12814 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN1P12814 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms