Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARBP10826 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RARBP10826 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RARBP10826 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARBP10826 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARBP10826 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARBP10826 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms