Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPD1P10809 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPD1P10809 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms