Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HKR1P10072 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms