Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms