Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms