Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4AP0C0L4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4AP0C0L4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms