Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA1P05813 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRYBA1P05813 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms