Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGKV1-16P04430 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms