Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC3P02656 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC3P02656 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC3P02656 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms