Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-DQB1P01920 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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