Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHBP01229 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHBP01229 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHBP01229 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHBP01229 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms