Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1RP00736 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1RP00736 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1RP00736 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1RP00736 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1RP00736 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms