Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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