Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYF2O95926 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYF2O95926 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYF2O95926 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SYF2O95926 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYF2O95926 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYF2O95926 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYF2O95926 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYF2O95926 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYF2O95926 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYF2O95926 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYF2O95926 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYF2O95926 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms