Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPINO95295 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms