Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFL1O94874 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFL1O94874 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
UFL1O94874 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFL1O94874 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms