Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTL6BO94805 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTL6BO94805 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms