Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKAP2O75563 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKAP2O75563 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms