Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM4AO75164 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM4AO75164 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms