Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA5O60264 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA5O60264 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms