Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNQ2O43526 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNQ2O43526 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms