Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRGAP3O43295 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRGAP3O43295 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms