Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CRXO43186 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CRXO43186 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CRXO43186 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRXO43186 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRXO43186 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRXO43186 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRXO43186 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms