Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms