Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNPHO15079 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNPHO15079 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNPHO15079 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms