Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM6BO15054 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6BO15054 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms