Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SUPT5HO00267 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SUPT5HO00267 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SUPT5HO00267 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SUPT5HO00267 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms