Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP23O00161 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms