Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KR12 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KR12 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KR12 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KR12 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KR12 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms