Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCER2I3L3R5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCER2I3L3R5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms