Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BQV1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BQV1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H3BQV1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
H3BQV1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BQV1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BQV1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BQV1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms