Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA8SH3BPF8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms