Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A8MVJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A8MVJ9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A8MVJ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms