Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP5A6NIR3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP5A6NIR3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms