Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPA6NDG6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGPA6NDG6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms