Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms