Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POTEFA5A3E0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms