Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
R4GN57 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
R4GN57 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
R4GN57 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R4GN57 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R4GN57 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
R4GN57 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R4GN57 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
R4GN57 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
R4GN57 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R4GN57 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R4GN57 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R4GN57 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
R4GN57 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R4GN57 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R4GN57 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
R4GN57 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R4GN57 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R4GN57 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R4GN57 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R4GN57 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R4GN57 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R4GN57 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R4GN57 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R4GN57 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R4GN57 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R4GN57 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R4GN57 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
R4GN57 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R4GN57 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R4GN57 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R4GN57 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R4GN57 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R4GN57 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R4GN57 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R4GN57 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R4GN57 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R4GN57 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
R4GN57 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R4GN57 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R4GN57 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
R4GN57 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R4GN57 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
R4GN57 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R4GN57 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
R4GN57 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R4GN57 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
R4GN57 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
R4GN57 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
R4GN57 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R4GN57 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R4GN57 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R4GN57 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
R4GN57 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R4GN57 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
R4GN57 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R4GN57 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
R4GN57 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
R4GN57 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R4GN57 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
R4GN57 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
R4GN57 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R4GN57 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R4GN57 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
R4GN57 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
R4GN57 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
R4GN57 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
R4GN57 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R4GN57 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
R4GN57 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R4GN57 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R4GN57 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
R4GN57 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
R4GN57 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms