Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NCOA3Q9Y6Q9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NCOA3Q9Y6Q9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NCOA3Q9Y6Q9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NCOA3Q9Y6Q9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms