Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KPTNQ9Y664 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KPTNQ9Y664 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KPTNQ9Y664 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms