Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHGB5Q9Y5G0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHGB5Q9Y5G0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHGB5Q9Y5G0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms