Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSUH2Q9Y2M2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSUH2Q9Y2M2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSUH2Q9Y2M2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSUH2Q9Y2M2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSUH2Q9Y2M2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms