Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A6Q9Y289 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC5A6Q9Y289 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A6Q9Y289 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A6Q9Y289 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A6Q9Y289 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms